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| 平臺名稱 | 依托單位 | 平臺級別 |
|---|---|---|
| 院海洋貝類工程技術研究中心 | 海洋貝類研究室 | 院級 |
| 院鲆鰈魚類遺傳育種工程技術中心 | 北戴河中心實驗站 | 院級 |
| 院漁業船舶與裝備工程技術研究中心 | 漁業機械儀器研究所 | 院級 |
| 院長江特色魚類工程技術研究中心 | 淡水漁業研究所 | 院級 |
| 院水產疫苗工程技術研究中心 | 珠江水產研究所 | 院級 |
| 院池塘生態工程技術研究中心 | 長江水產研究所 | 院級 |
| 院鹽堿水域漁業工程技術研究中心（哈爾濱） | 黑龍江水產研究所 | 院級 |
| 院網箱工程技術研究中心 | 南海水產研究所 | 院級 |
| 院水產品加工及綜合利用工程技術研究中心 | 南海水產研究所 | 院級 |
| 院鹽堿水域漁業工程技術研究中心（上海） | 東海水產研究所 | 院級 |
| 院海洋捕撈工程技術研究中心 | 東海水產研究所 | 院級 |
| 院海洋食品與生物制品工程技術研究中心 | 黃海水產研究所 | 院級 |
| 院海水魚類工程技術研究中心 | 黃海水產研究所 | 院級 |
| 院鱘魚繁育工程技術中心 | 中國水產科學研究院 | 院級 |
| 廣東省水產疫苗工程技術研究中心 | 珠江水產研究所 | 省級 |
| 中國水產科學研究院黑龍江水產研究所淡水魚類育種省級工程實驗室 | 黑龍江水產研究所 | 省級 |
| 廣東省水產良種工程技術研究中心 | 珠江水產研究所 | 省級 |
| 黑龍江省冷水性魚類育種工程技術研究中心 | 黑龍江水產研究所 | 省級 |
| 廣東省網箱工程技術研究中心 | 南海水產研究所 | 省級 |
| 廣東省水產品精深加工及副產物高效利用工程技術研究中心 | 南海水產研究所 | 省級 |
| 山東省海洋生物資源利用和質量安全控制工程研究中心 | 黃海水產研究所 | 省級 |
| 淡水魚類育種國家地方聯合工程實驗室 | 黑龍江水產研究所 | 國家級 |
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